Page 152 - 磁共振成像2024年7期电子刊
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磁共振成像 2024年7月第15卷第7期 Chin J Magn Reson Imaging, Jul, 2024, Vol. 15, No. 7 技术研究||Technical Article
为剥离重合值点、富集边缘疏散点,先计算重合
点中二维投影坐标最接近该整数点的作为不动点,
其余为剥离点。将重合点的 8 邻点划分为 16 个区,
根据剥离点所属象限与斜率得到所属扇区,每个邻
点(落值点)包括两个扇区。依此选择得到的为最优
落值点,按序检查落值点是否为空,为空则剥离,不
为空则进行次优匹配直至所有重合值均从整数点上
剥离,如图 2所示。最后根据原始近邻关系对边缘疏
散点作提拉。
图1 最优插值球面映射过程。
Fig. 1 Steps for optimal interpolation spherical mapping.
1.4.1 提取脑区
基于 Desikan-Killiany(DK)脑图谱,大脑被划分
为 68 个有效脑区(左右脑各 34 个)。利用 FreeSurfer
[27]
已经重建于球体表面的 DK 脑图谱 ,对每一个脑区
选择自己的中心点 ,从脑图和球面点集中得到点
的 三 维 坐 标 、所 属 脑 区 与 近 邻 关 系 。 遍 历 共 计
326 448 个有效值点,删除所有非同区邻点关系并整
理出新的元胞关系表与最大邻点数。
图 2 十六区最优匹配。2A:十六区最优匹配的区域划分方式、邻点包
1.4.2 平面投影 括的扇区与匹配方向。2B:本研究最优化插值方法的流程图示意。
对每个脑区计算其形心并规定中心为近形心点 Fig. 2 Sixteen-region optimal matching algorithm. 2A: The region
division method, the sectors included in the neighbor points and the
(距离形心欧氏距离最短),过该点作曲面的切平面。 matching direction of the sixteen-region optimal matching. 2B: The
对区内所有点有通过自身与球心的空间直线,该线 flowchart of the optimal interpolation method in this study.
与切平面的交点即为该点在切平面上的投影点。 1.5 特征提取
为弥补两点式方程的缺陷(当原坐标位于任何 使用开源 Python 软件包 Pyradiomics 从以 CT、
一坐标轴平面,即三维坐标中出现任何 0值使得分式 GMV、CC 与 CSA 为灰度值的图像矩阵中提取 2D 影
无意义),选择性地改变自变量方程的形式,去除投 像组学特征。为提高特征提取的精度和数目,需要
影的零值边界。 去除掩膜空洞并对图像做小波变换、梯度变换、平方
完成空间平面投影后需将三维平面映射到二维 变换、平方根变换、对数变换与指数变换,基于每一
平面——这涉及到一个二维直角坐标系的选取:对 种形式提取一阶特征、灰度共生矩阵特征(gray level
每个脑区的投影平面规定投影中心(零点)到其最近 co-occurrence matrix, GLCM)、灰 度 游 程 矩 阵 特 征
邻点的向量方向为 X 轴正方向,选取该向量所确定 (gray level run length matrix, GLRLM)、相邻灰度差
的平面束中法向量为 Y 轴的平面作为分界面,任意 矩 阵 特 征(neighbouring gray tone difference matrix,
选择一个除中心和最邻近点外的第三投影点,其所 NGTDM)、灰度相关矩阵特征(gray level dependence
在分界侧面作为Y轴正方向。 matrix, GLDM)、灰度大小区域矩阵特征(gray level
对脑区内所有投影点计算与零点的欧氏距离和 size zone matrix, GLSZM)。
与 X 轴正向量的夹角,通过极坐标系转换得到投影 1.6 特征评估
点二维映射的坐标值,利用分界面作为方向的布尔 基于 kirby-21 数据集,以 DK 脑图谱划分的单独
选择器确定 y值正负。最后为将二维坐标嵌入矩阵, 脑区为单位,计算 21 例被试先后两次测试的组内相
选择合适的尺度对二维坐标值四舍五入进行预规
关系数(intra-class correlation coefficient, ICC)值来评
整,并为映射点规整后的重合记录重合表。
价特征的复测信度,以此筛去不可信特征。ICC借助
1.4.3 投影坐标嵌入图像矩阵
多因素方差分析中的行变量效应与列变量效应评估
预规整虽然极大地提高了嵌入图像矩阵的效 一致性 ,对本研究需考虑评定者系统误差选择合适
[28]
率,但由于数据本身并不整齐会造成坐标值由于靠 度量的 Model以确定信度系数的计算方法。形式上,
近同一整数而发生挤压,在投影图像任意部分产生 对于给定的测量重复k次实验,ICC计算见式(1)。
空洞点。且球面局部投影的效果总是随着投影面片
ICC= MS R - MS w (1)
面积的增加而下降,这导致投影结果中心稠密而边 MS R + (k - 1)MS w
缘疏散,在边缘产生大量疏散空洞(图1)。 其中 MS R 是行变量均方(被试者间平方和), MS w
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