Page 151 - 磁共振成像2024年7期电子刊
P. 151

技术研究||Technical Article              磁共振成像  2024年7月第15卷第7期  Chin J Magn Reson Imaging, Jul, 2024, Vol. 15, No. 7


           0 引言                                                1 材料与方法
               世界卫生组织最新的一项报告显示,世界上每                            1.1 研究对象
           8 人中就有 1 人罹患精神障碍 。而在脑疾病的诊断                               本文所有数据来自于 Kennedy Krieger 脑成像研
                                     [1]
           中,大部分依靠主观量表,还未找到一种有效的生物                             究 中 心 的 kirby-21 数 据 集(https://rdrr. io/github/
           标志物用以揭示其结构与功能机制。近年来,MRI                             adigherman/kirby21.mricloud/man/Kirby-21-MRICloud-
                                                                         [22]
           技术的高速发展为我们认识各类脑疾病打开了新的                              Data.html) 与 ADHD-200 项目(http://preprocessed-
                                                     [2]
           视角。MRI 根据成像方式分为功能像与结构像 ,传                           connectomes-project.org/adhd200)中北京大学中心的
           统 脑 结 构 研 究 主 要 以 基 于 体 素 的 形 态 学 测 量               数据。本研究遵守《赫尔辛基宣言》,所有被试均签
          (voxel-based morphometry, VBM)为主,常利用灰质               署了知情同意书,并获得相关伦理机构的批准。
                                 [3]
           体积来表征脑结构特征 或脑疾病病灶 。VBM 的                                 kirby-21数据集包含了 21名健康志愿者(无神经
                                               [4]
           应用虽然十分广泛,但其自动归一化算法在处理脑                              系统疾病史)的数据,年龄 22~61岁,他们在两周的时
           影像数据时可能会改变异常沟回的拓扑结构,导致                              间间隔内完成了两次 MRI 扫描。ADHD-200 多动症
                                     [5]
           提取的形态学特征发生错位 。其次,VBM 的方法                            数据集中来自北京大学数据中心的研究对象为
           侧重于脑体积计算,无法直接测量复杂的皮层拓扑                              222 例,其中 95 例为多动症患者,127 例为健康被试,
               [6]
           结构 。因此,近些年的研究更多地开始使用基于表                             年龄7~27岁。
                                                               1.2 图像采集
           面的形态学分析(surface-based morphometry, SBM)
                                                                    kirby-21 数据集中每个被试两次 T1WI图像均使
           对大脑结构进行分析。SBM 采用的皮质表面网格球
                                                               用荷兰 Philips Achieva 3.0 T MR 扫描仪及配套的
           形配准提高了大脑配准的准确性,该方法使定位更
                 [7]
           加精准 的同时,将许多大脑内部拓扑结构提升到表                             8 通道相控阵(SENSitivity Encoding, SENSE)头线圈
                                                               采集。参数如下:分辨率 1.0 mm×1.0 mm×1.2 mm,
           面,挖掘出更多深层特征           [8-9] 。
                                                               采集时间 6 min,TR 6.7 ms,TE 3.1 ms,TI 842 ms,翻
               然而既往许多研究仅将 SBM的单一指标均值作
                                                               转角 8°,视野 240 mm×256 mm,层数 170,SENSE 加
           为特征,不能很好地反映脑区特性              [10-12] 。影像组学是一
                                                               速度因子2。
           种从医学影像中高通量地提取大量可复现信息的技
                                                                    ADHD-200 数据集北京大学数据中心的 T1WI
           术 。它可以获得感兴趣区(region of interest, ROI)的              图像使用德国 Siemens 3.0 T MAGNETOM Trio Tim
             [13]
                                              [14]
           成像特征,对其进行全面的可重复评估 ,定量并客
                                                               扫描仪及 8 通道头线圈采集。参数如下:分辨率为
           观地描述异质性 。基于特征的经典影像组学方
                          [15]
                                                               1.3 mm×1.0 mm×1.3 mm,采集时间 8 min,TR 2530 ms、
             [16]
           法 已经被广泛地运用于生物医学工程领域 。如
                                                    [17]
                                                               TE  3.37  ms、TI  1100  ms,翻 转 角 9° ,视 野 250  mm×
           在脑疾病领域,影像组学已被应用于脑胶质瘤的研
                                                               250 mm,层数128,矩阵256×256。
           究,用于预测脑胶质瘤的生存情况 ,并基于脑胶质
                                          [18]
                                                               1.3 MRI数据预处理
           瘤数据建立了生物学功能和脑影像组学特征间的对
                                                                    使用基于 Linux 系统的 Freesurfer 5.3 对 T1WI 数
           应关系 。在精神疾病的研究中,影像组学特征也被                             据 做 预 处 理 与 配 准 分 割 ,提 取 皮 质 厚 度(cortical
                 [19]
                                    [20]
           用于表征脑区间的相互关系 ,发掘特定功能所涉及
                                                               thickness, CT)、灰质体积(gray matter volume, GMV)和
           的具体区域 。上述研究说明影像组学作为一种行
                     [21]
                                                               基于表面的皮层平均曲率(cortical mean curvature,
           之有效的特征提取方法,对捕获异质性及各类疾病
                                                               CC)、皮层表面积(cortical surface area, CSA)共计四
           的预测都具有良好的效果。考虑到 SBM和影像组学                            个形态指数。
           的优势,两者的结合必将挖掘更深层次的脑部影像                                   主要包括以下几个技术步骤:局部自适应分割、
           特征,其难点在于如何实现三维皮层表面到二维图                              CT和中央表面估计、拓扑校正、球面映射与配准。其
           像的映射。                                               中对 CT 的处理采用基于投影厚度(projection-based
               综上,本研究将 SBM方法与影像组学相结合,以                         thickness, PBT)的方法 ,它允许适当处理部分体积
                                                                                    [23]
           不同的脑区作为不同的 ROI,创新性地将表面形态学                           信息与沟回模糊 ,以及没有明确重建的脑沟不对
           指数代替图像灰度值作为特征的提取对象,提出了                              称 。在初始表面重建完成后使用球谐函数进行拓
                                                                 [24]
           一种将脑图谱从球面映射到图像矩阵的完整方法。                              扑校正 和表面细化,最后将中心表面利用球面映射
                                                                      [25]
           此外,为了对特征进行合理选择和分析,利用 2D 影                           匹配到Freesurfer的"FsAverage"模板上完成配准 。
                                                                                                          [26]
           像组学特征的复测信度评估特征有效性。最后,结                              1.4 最优插值球面映射
           合多动症数据集进行多动症症状指标的预测与相关                                   为将三维脑表面特征作为2D影像组学的图像输
           分析,来进一步验证这种脑影像组学特征提取方法                              入,本研究提供一种基于球面局部投影的最优化插值
           的临床价值。以上工作旨在为脑影像的研究提供新                              方法。方法主要包括脑区提取、三维曲面到二维平面
           的视角与方法,并为临床应用提供参考。                                  的降维映射、映射坐标嵌入图像矩阵三个步骤(图1)。
          ·144 ·                                                                      https://www.chinesemri.com
   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156